مطالعه بیوانفورماتیکی توالی‌های پروتئین آلیناز در گیاهان
نویسندگان: ثبت نشده
چکیده مقاله:
آلیناز (EC 4.4.1.4) آنزیمی وابسته به پیریدوکسال فسفات است که تبدیل آلین به آلیسین را انجام می‌دهد. آلیسین ترکیبی ارگانوسولفوره با ویژگی‌های ضد‌میکروبی، ضد‌سرطانی، ضد‌دیابتی و آنتی‌اکسیدانی است. مطالعه بر روی آلیناز و درک چگونگی تنظیم تولید آلیسین برای تولید در محل آن جهت مصارف کلنیکی ضروری است. در این مطالعه، توالی‌های پروتئین آلیناز گیاهی از سایت ExPASy و NCBI دریافت‌شدند و با ClustalW همردیفی صورت‌پذیرفت. نتایج این همردیفی شباهت 39-98 درصدی را میان توالی‌ها نشان‌داد. درخت فیلوژنی برای این توالی‌های پروتئینی با استفاده از نرم‌افزار MEGA4 و با روش نزدیکترین همسایه رسم‌شد. خانواده‌های Alliacea و Poaceae به خوبی در این درخت از هم تفکیک شده‌بودند. همچنین به کمک ابزارCD search موجود در سایت NCBI، EFG alliinase و AAT به عنوان دو دومین این پروتئین شناخته‌شدند.
منابع مشابه
استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی برای مطالعه پروتئین مایوستاتین
ژن مایوستاتین متعلق به خانواده فاکتورهای تمایز رشد (tgf-β) میباشد که در رشد و نمو و بلوغ و بهطور اختصاصی در توسعه ماهیچه اسکلتی بالغ بیان میشود. در این پژوهش با بهره گیری از نرمافزارهای بیوانفورماتیکی، توالی اسیدآمینهای پروتئین مایوستاتین در گونههای مختلف ازجمله گاو، گوسفند، بز، اسب، خوک، مرغ، بوقلمون، اردک، غاز، کبوتر، موش و انسان بررسی شد. در همردیفی بخش پایانی پروتئین مایوستاتین (فر...
متن کاملطراحی بیوانفورماتیکی پروتئین گیرنده IFN-α/βنوترکیببرای مقابله با اثرات آنتاگونیستی پروتئین VP35ویروس ابولا (Ebola)
پروتئین VP35 ویروس ابولا یکی از مهمترین ترکیبات بیماری‌زایی واکنش کننده با سلول‌های میزبان است که با پاسخ ایمنی‌زایی طبیعی سلول‌های بدن تداخل ایجاد می‌کند.VP35 این کار را با توانایی آنتاگونیستی خود که مانع از فعالیت فاکتور تنظیمی اینترفرون به نام پروتئین فاکتور ۳ (IRF-3) در سلول‌های آلوده به ویروس میشود انجام می‌دهد و القا بیان ژن‌های ضد ویروسی را مختل می‌کند. در مطالعه حاضر ما در فضای مجازی پ...
متن کاملمطالعه توالی، خاصیت آنتی‌ژنی و ساختار سه بعدی پروتئین های غیراختصاصی ناقل لیپید2 در برنج ایرانی: ارزیابی بیوانفورماتیکی
پروتئین‌های غیراختصاصی ناقل لیپید 2(nsLTP2) یکی از اعضای خانواده پرولامین‌ها هستند که به دلیل ساختار ویژه خود توانایی انتقال ترکیبات لیپوفیل مختلفی را دارند. با وجود مزیت‌های نسبی پروتئین LTP2 در انتقال دارو، خاصیت آلرژنی این پروتئین‌ها نیز گزارش شده است. هدف مطالعه حاضر بررسی توالی و ساختار پروتئین nsLTP2 برنج ایرانی و نیز بهبود برخی از ویژگی های آن برای استفاده در سیستم‌های تحویل دارو، توسط...
متن کاملبررسی بیوانفورماتیکی ژن آسیل کریر پروتئین (ACP) در یوکاریوت‌ها و پروکاریوت‌ها
مسیر بیوسنتز اسید چرب یکی از مسیرهای مهم در بدن اکثر موجودات (پروکاریوت‌ها و یوکاریوت‌ها) است که آنزیم Acyl carrier protein (ACP) نقش مهمی در مسیر بیوسنتز اسید چرب دارد. هدف از این مطالعه آنالیز in silico و فیلوژنتیکی ژن ACP است. با آنالیز های بیشتر مشخص شد که ژنACP در پروکاریوت‌ها دارای 4 اگزون و 3 اینترون و 2mRNA و در یوکاریوت‌ها دارای 13 اگزون، 12 اینترون و 9 mRNA است. این پروتئین در یوکا...
متن کاملمطالعه بیوانفورماتیکی ویژگی های ایمونوژنیک پروتئین سطحی جاذب آهن در اسینتوباکتر بومانی
اسینتوباکتر بومانی یک باکتری گرم منفی غیرمتحرک است که سبب عفونت های شدید در افراد مستعد می گردد. به علاوه ایزوله های کلینیکی اسینتوباکتر بومانی افزایش مقاومت قابل توجهی را نسبت به درمان های آنتی بیوتیکی موجود نشان می دهند که درمان عفونت های این باکتری را با مشکل رو به رو ساخته است. به عنوان یک مکانیسم دفاعی دسترسی آهن برای باکتری ها در میزبان محدود شده است. اولین مرحله در جذب اختصاصی آهن از طری...
15 صفحه اولمطالعه بیوانفورماتیکی ویژگی های ایمونوژنیک پروتئین های با بیان متأثر از آهن در باکتری acinetobacter baumannii
baumannii acinetobacter یک پاتوژن بیمارستانی با قدرت بیماری زایی در حال رشد است. این باکتری عفونت-های مقاوم به چندین آنتی بیوتیک ایجاد می کند و به درمان های دارویی و مواد ضد میکروبی به شدت مقاوم است. به همین علت نیاز روز افزونی به توسعه روش های جدید درمان بر علیه این پاتوژن نیاز است. سیستم های اکتساب آهن فاکتور های مهم ویرولانس این باکتری پاتوژن هستند. آنتی بادی بر علیه پروتئین های غشایی تحت تن...
منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 7 شماره 4
صفحات 318- 328
تاریخ انتشار 2016-02-20
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023